Ediciones Universidad de Salamanca / CC BY-NC-SA Ciencia Policial, 182, 145-172 160 CIENCIAPOLICIAL 3.4 Bioinformática Las técnicas de genómica y proteómica generan una gran cantidad de datos en bruto que necesitan ser tratados informáticamente. Las aplicaciones bioinformáticas usan algoritmos matemáticos, la estadística y procesos lógicos informáticos para organizar y analizar enormes cantidades de datos de origen biológico y darles un sentido. Para realizar estos cálculos, los programas de bioinformática se ayudan de bases de datos en las que previamente se han introducido la secuenciación del ADN o el proteoma completo de los microorganismos. Por este motivo, es necesario contar con potentes bases de datos que contengan el mayor número de agentes patógenos posibles, así como sus más cercanos familiares, con el fin de minimizar en lo posible la aparición tanto de falsos positivos, por la asignación de un microorganismo relacionado filogenéticamente con un patógeno, al no tenerlo incluido en la base de datos, así como de falsos negativos al no disponer de la información precisa de ese patógeno. Esta diferenciación entre microorganismos emparentados filogenéticamente es un reto que los propios programas de asignación pueden tener incluso con una buena base de datos, por ello la investigación y el desarrollo de nuevas plataformas continúa avanzando. Diversas agencias dedicadas a la vigilancia en biodefensa y epidemiológica han desarrollado aplicaciones de fuente abierta como SURPI (Sequence-based UltraRapid Pathogen Identification) o EDGE (Enpowering the Development of Genomics Expertise) (Minogue et al., 2018), que ayudan a la interpretación de los datos de una secuencia genómica. Paralelamente, en proteómica podemos encontrar herramientas bioinformáticas como SEQUEST®, PRIDE, PEPTIDEATLAS o PROTEOME COMMONS y una variedad de bases de datos de secuencias de microorganismos (Aslam et al., 2017). La selección de una base de datos enfocada al problema de interés es importante, de tal manera que sea lo bastante amplia para evitar falsos negativos, así como restringida, para evitar señuelos y falsos positivos en la identificación de un AB en una muestra. Las bases de datos diseñadas con fines bioforenses deben contar adicionalmente con una información asociada a cada microor-
RkJQdWJsaXNoZXIy MzA5NDI2